安徽黃山經濟開發區于2006年7月18日經安徽省人民政府批準同意正式籌建省級開發區，執行省級開發區相關政策。黃山經濟開發區管委會于2006年委托安徽省環境科學研究院編制《黃山市新城區（經濟技術開發區）區域環境影響報告書》，該報告于2006年3月21日經原安徽省環境保護局《關于黃山市新城區（經濟技術開發區）區域環境影響報告書的批復》（環評函【2006】139號）進行了批復。

安徽黃山經濟開發區自籌建以來，原核定范圍已建成6.85平方公里，已入駐企業97家。經過近幾年的發展，截止2012年，開發區累計完成固定資產投資188.16億元，其中基礎施建設投資26.62億元，總產值達到31.1億元，工業增加值達到7.2億元；區內主要道路全線貫通，并實現了美化、綠化、亮化目標，規劃區內基本實現“五通一平”，項目承載能力得到根本提升。

2006年11月，黃山市人民政府以《關于屯溪區九龍新區納入安徽黃山經濟開發區管理的批復》（黃政函【2006】133號）將九龍園區納入黃山市經濟開發區管理，即黃山經濟開發區“南區”，享受市委、市政府給予市經濟開發區的所有優惠政策。

根據開發區發展規劃，安徽黃山經濟開發區現擬在屯溪區九龍擴區，主要為九龍低碳經濟園，擴區面積3.32平方公里，四至范圍：西至環城西路，東、北臨迎賓大道，南至占飛路，擴區后總面積13.32平方公里。